教員・研究員紹介
-
川下 理日人
（かわした のりひと）
- 准教授 博士（薬学）
-
所属学科/エネルギー物質学科
所属専攻/理学専攻 東大阪モノづくり専攻（兼担）
コンピュータ、時にはスパコンを利用した、計算化学・バイオインフォマティクスなどの手法を用いて、分子進化・薬剤感受性・蛋白質間相互作用など、生命科学における諸現象の解明を目指しています。
コンピュータで生命を科学する
| 専門 |
計算化学、バイオインフォマティクス、蛋白質間相互作用、感染症、薬剤耐性、分子進化 |
| 担当科目（学部） |
【エネルギー物質学科】エネルギー物質概論、化学数学演習、物理数学演習、基礎化学情報処理、数理情報処理、量子化学、計算生体物質科学、基礎ゼミ1，2、卒業研究ゼミナール、卒業研究【生命科学科】バイオインフォマティクス、化学実験、卒業研究ゼミナール、生命科学ゼミナールI、II、卒業研究 |
| 担当科目（大学院） |
【大学院理学専攻】計算生命科学特論、生体分子化学・環境化学総論、生物・環境化学特別研究、遺伝サービス情報学、人類遺伝学演習、臨床遺伝学1、遺伝カウンセリングII【東大阪モノづくり専攻】機能性物質開発特論、東大阪モノづくり特別演習、東大阪モノづくり特別研究 |
| 主な研究テーマ |
スーパーコンピュータ「富岳」を利用した蛋白質間相互作用解析
蛋白質間相互作用阻害剤の分子設計関連研究
分子進化学的手法による病原性因子の同定と変異発現機序の解明
分子モデリングを利用した遺伝性疾患およびウイルス感染機構の解明 |
| 代表的な研究業績 |
(1) Takaba K, Watanabe C, Tokuhisa A, Akinaga Y, Ma B, Kanada R, Araki M, Okuno Y, Kawashima Y, Moriwaki H, Kawashita N, Honma T, Fukuzawa K, Tanaka S.
Protein-ligand binding affinity prediction of cyclin-dependent kinase-2 inhibitors by dynamically averaged fragment molecular orbital-based interaction energy.
J Comput Chem., 43(20), 1362-1371, (2022).
doi: 10.1002/jcc.26940
(2) Watanabe K, Watanabe C, Honma T, Tian YS, Kawashima Y, Kawashita N, Takagi T, Fukuzawa K.
Intermolecular Interaction Analyses on SARS-CoV-2 Spike Protein Receptor Binding Domain and Human Angiotensin-Converting Enzyme 2 Receptor-Blocking Antibody/Peptide Using Fragment Molecular Orbital Calculation.
J Phys Chem Lett., 12(16), 4059-4066, (2021).
(3) Tian Y.-S., Zhou Y., Takagi T., Kameoka M., Kawashita N.
Dengue Virus and Its Inhibitors: A Brief Review
Chem. Pharm. Bull. 66(3), 191-206, (2018).
|
| 研究内容・研究成果 |
|
| researchmap |
http://researchmap.jp/KN002913 |
| 研究総覧 |
https://research.kindai.ac.jp/profile/ja.b4046412b6c39fa2.html?mode=pc |
| 所属学協会 |
日本薬学会（構造活性相関部会、物理系薬学部会）
日本ウイルス学会
日本バイオインフォマティクス学会
日本人類遺伝学会
日本遺伝性腫瘍学会
日本遺伝子診療学会
日本遺伝カウンセリング学会
近畿化学協会（コンピュータ化学部会ほか） |
| 学外活動 |
日本薬学会構造活性相関部会 常任幹事（会計幹事）
日本遺伝性腫瘍学会 評議員
近畿化学協会 コンピュータ化学部会 幹事 |
| 出身大学 |
大阪市立大学理学部物質科学科 |
| 出身大学院 |
大阪大学大学院薬学研究科 |
| 論文名、取得大学、取得年月 |
芳香族 Pummerer 型反応を利用する多置換複素環化合物の新合成、大阪大学、2005年9月 |
| 主な経歴 |
大阪大学微生物病研究所 特任助手・特任助教（2005-2007年）
大阪大学大学院薬学研究科 助教（2007-2017年）
大阪大学微生物病研究所 助教（兼任）（2008-2017年）
近畿大学理工学部生命科学科 講師（2017-2022
年）
近畿大学理工学部エネルギー物質学科 准教授（2022年-現在） |
| 受賞歴 |
有機合成若手セミナー優秀研究発表賞（2004年）
第32回情報化学討論会ポスター賞（共同）（2009年）
Journal of Computer Aided Chemistry論文賞（共同）（2016年9月） |
| 学生へのアドバイス |
講義などで得た知識は、ただ覚えるだけでは意味がなく、それをもとに自分で考え応用できるかが重要です。ぜひ自分で色々と考えて行動できる人になってください。 |
| 学生に薦めたい書物 |
分子からみた生物進化 DNAが明かす生物の歴史（宮田隆著、講談社ブルーバックス）
寺田寅彦随筆集（寺田寅彦著、小宮豊隆編、岩波文庫）
セレンディピティー ―思いがけない発見・発明のドラマ― （ロバーツ R. M. 著、安藤喬志訳、化学同人） |
| 趣味・その他 |
合唱、ゴルフ、旅行、ドライブ |
計算生体物質科学研究室
教員・研究員紹介
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string(410) "【エネルギー物質学科】エネルギー物質概論、化学数学演習、物理数学演習、基礎化学情報処理、数理情報処理、量子化学、計算生体物質科学、基礎ゼミ1，2、卒業研究ゼミナール、卒業研究【生命科学科】バイオインフォマティクス、化学実験、卒業研究ゼミナール、生命科学ゼミナールI、II、卒業研究"
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string(467) "Introduction to Energy and Materials
Exercises for Mathematics in Chemistry
Exercises for Mathematics in Physics
Synthetic Seminar 1 and 2
Bioinformatics (Department of Life Science)
Chemistry Laboratory (Department of Life Science)
Seminar for Bachelor Thesis (Department of Life Science)
Seminar for Life Science 1 and 2 (Department of Life Science)
Individual Study for Bachelor Thesis (Department of Life Science)"
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string(375) "【大学院理学専攻】計算生命科学特論、生体分子化学・環境化学総論、生物・環境化学特別研究、遺伝サービス情報学、人類遺伝学演習、臨床遺伝学1、遺伝カウンセリングII【東大阪モノづくり専攻】機能性物質開発特論、東大阪モノづくり特別演習、東大阪モノづくり特別研究"
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string(646) "Computational Life Science
Introduction to Advanced Studies on Biomolecules and Environmental Chemistry
Advanced Studies on Biomolecules and Environmental Chemistry
Bioinformatics for Genetic Counseling (Genetic Counseling Course)
Advanced Exercise in Human Genetics (Genetic Counseling Course)
Clinical Genetics 1 (Genetic Counseling Course)
Genetic Counseling II (Genetic Counseling Course)
Supplemental Nutrition Substances (Innovative Engineering)
Exercise Lesson in Innovative Engineering (Innovative Engineering)
Master Study in Innovative Engineering (Innovative Engineering)"
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string(330) "スーパーコンピュータ「富岳」を利用した蛋白質間相互作用解析
蛋白質間相互作用阻害剤の分子設計関連研究
分子進化学的手法による病原性因子の同定と変異発現機序の解明
分子モデリングを利用した遺伝性疾患およびウイルス感染機構の解明"
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string(326) "Protein-protein interaction analysis by supercomputer "Fugaku".
Drug design related studies for protein-protein interaction inhibitor
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string(1693) "(1) Takaba K, Watanabe C, Tokuhisa A, Akinaga Y, Ma B, Kanada R, Araki M, Okuno Y, Kawashima Y, Moriwaki H, <strong><u>Kawashita N</u></strong>, Honma T, Fukuzawa K, Tanaka S.<br /><br /><br /><br />Protein-ligand binding affinity prediction of cyclin-dependent kinase-2 inhibitors by dynamically averaged fragment molecular orbital-based interaction energy.<br /><br /><br /><br /><em>J Comput Chem</em>., <strong>43</strong>(20), 1362-1371, (2022).<br /><br /><br /><br />doi: 10.1002/jcc.26940<br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br />(2) Watanabe K, Watanabe C, Honma T, Tian YS, Kawashima Y, <strong><u>Kawashita N</u></strong>, Takagi T, Fukuzawa K.<br /><br /><br /><br />Intermolecular Interaction Analyses on SARS-CoV-2 Spike Protein Receptor Binding Domain and Human Angiotensin-Converting Enzyme 2 Receptor-Blocking Antibody/Peptide Using Fragment Molecular Orbital Calculation.<br /><br /><br /><br /><em>J Phys Chem Lett</em>., <strong>12</strong>(16), 4059-4066, (2021).<br /><br /><br /><br /><br /><br /><br /><br />(3) Tian Y.-S., Zhou Y., Takagi T., Kameoka M., <u><strong>Kawashita N</strong></u>.<br /><br /><br /><br />Dengue Virus and Its Inhibitors: A Brief Review<br /><br /><br /><br /><em>Chem. Pharm. Bull</em>. <strong>66</strong>(3), 191-206, (2018)."
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string(385) "Designated Research Associate, Designated Assistant Professor, Research Institute for Microbial Diseases, Osaka University (2005-2007)
Assistant Professor, Graduate School of Pharmaceutical Sciences, Osaka University (2007-2017)
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