教員・研究員紹介
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飯田 慶
（いいだ けい）
- 講師 博士（理学）
-
所属学科/生命科学科
所属専攻/理学専攻
- 研究キーワード：
- 機械学習／バイオインフォマティクス／ゲノム解析／遺伝子／がん研究／医療と生命科学／脳神経科学
近年、高速シークエンサーの発達より、細胞内の分子の種類や数、また相互作用などの情報の蓄積が急速に進んでいます。本研究室では特にRNAの転写制御や、RNA修飾・スプライシングといった転写後制御に着目し、ビッグデータ解析を通じて、生命現象の理解や医療の発展につながる情報の創出を目指します。
| 専門 |
情報生物学, RNA生物学 |
| 担当科目（学部） |
バイオインフォマティクス、生物統計学 |
| 担当科目（大学院） |
生物データ科学特論 |
| 主な研究テーマ |
・ RNAスプライシング・RNA代謝を介した生体機能制御
・ ゲノム塩基配列からのスプライシング暗号の解明
・ RNA結合タンパク質の機能的結合標的同定のためのバイオインフォマティクス解析 |
| 代表的な研究業績 |
(1) Matsushima S,. Ajiro M., Iida K., Chamoto K., Honjo T. and Hagiwara M. "Chemical induction of splice-neoantigens attenuates tumor growth in a preclinical model of colorectal cancer." Sci Transl Med. Vol. 14 No. 673, eabn6056. (2022)
(2) Iida K., Hagiwara M. and Takeuchi A. "Multilateral Bioinformatics Analyses Reveal the Function-Oriented Target Specificities and Recognition of the RNA-Binding Protein SFPQ." iScience, Vol. 23 No. 7 Article# 101325. (2020)
(3) Merkurjev D., Hong W.T., Iida K., et al. "Synaptic m6A Epitranscriptome Reveals Functional Partitioning of Localized Transcripts for Dynamic Tripartite Synapse Modulation." Nat Neurosci., Vol.21 No.7 pp.1004-1014. (2018)
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| 研究内容・研究成果 |
・低分子化合物を用いてRNAスプライシングプロファイルを変化させることにより、がん細胞におけるネオアンチゲンの発現を誘導し、がん免疫チェックポイント阻害剤の効果を増強できることを示した（Matsushima et al. 2022）。
・神経細胞において、特定のRNA結合タンパク質が、非常に長い遺伝子の転写成立に寄与していることを解明した（Takeuchi et al. 2018, Iida et al. 2020）。
・神経細胞のシナプスにおいて、細胞接着や神経シグナル伝達に関わる遺伝子由来のmRNAの多くがm6A修飾を受けていることを明らかにした（Merkurjev et al. 2018）。
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| researchmap |
https://researchmap.jp/read0118609 |
| 所属学協会 |
日本RNA学会、分子生物学会、日本メディカルAI学会 |
| 出身大学 |
名古屋大学 理学部 |
| 出身大学院 |
名古屋大学 大学院 理学研究科 |
| 論文名、取得大学、取得年月 |
Adaptive changes of alternative splicing profiles and its regulating system in Arabidopsis thaliana 名古屋大学 2006年7月 |
| 主な経歴 |
理化学研究所 植物ゲノムセンター テクニカルスタッフ (2002年-2003年)
長浜バイオ大学 バイオサイエンス学部 助手 (2004年-2007年)
カリフォルニア州立 カリフォルニア大学 リバーサイド校 ポスドク研究員 (2007年-2008年)
理化学研究所 生命情報基盤研究部門 研究員 (2008年-2012年)
京都大学 医学研究科 特定助教(2012年-2022年)
京都大学 医学研究科 特定准教授(2024年-現在、クロスアポイントメント) |
| 学生へのアドバイス |
いろいろな事にチャレンジしてください。 |
| 学生に薦めたい書物 |
新訂 孫子 (岩波文庫)
ヒトゲノムを解読した男 クレイグ・ベンター自伝 (J・クレイグ・ベンター (著), 野中香方子 (訳), 化学同人)
ヘルシープログラマ (Joe Kutner (著), 玉川 竜司 (訳), オライリージャパン) |
生物データ科学研究室
教員・研究員紹介
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(2) <u>Iida K.</u>, Hagiwara M. and Takeuchi A. "<strong>Multilateral Bioinformatics Analyses Reveal the Function-Oriented Target Specificities and Recognition of the RNA-Binding Protein SFPQ.</strong>" <em>iScience,</em> Vol. 23 No. 7 Article# 101325. (2020)<br />
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(3) Merkurjev D., Hong W.T., <u>Iida K.</u>, <em>et al.</em> "<strong>Synaptic m6A Epitranscriptome Reveals Functional Partitioning of Localized Transcripts for Dynamic Tripartite Synapse Modulation.</strong>" <em>Nat Neurosci.,</em> Vol.21 No.7 pp.1004-1014. (2018)"
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・神経細胞において、特定のRNA結合タンパク質が、非常に長い遺伝子の転写成立に寄与していることを解明した（Takeuchi <em>et al.</em> 2018, Iida <em>et al.</em> 2020）。<br />
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・神経細胞のシナプスにおいて、細胞接着や神経シグナル伝達に関わる遺伝子由来のmRNAの多くがm6A修飾を受けていることを明らかにした（Merkurjev <em>et al. </em>2018）。"
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理化学研究所 生命情報基盤研究部門 研究員 (2008年-2012年)
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