Researchers

NAKAMURA Shinya

NAKAMURA Shinya
Lecturer
Faculty Department of Pharmaceutical Sciences
Researchmap https://researchmap.jp/nakas

Education and Career

Academic & Professional Experience

  • Apr. 2018 - Today , Kindai University Faculty of Pharmacy 講師
  • Apr. 2013 - Mar. 2018 , Kindai University Faculty of Pharmacy 助教
  • Apr. 2008 - Mar. 2013 , Kindai University Faculty of Pharmacy 助手
  • Apr. 2007 - Mar. 2008 , 株式会社菱化システム 計算科学部

Research Activities

Research Areas

  • Life sciences, Pharmaceuticals - analytical and physicochemistry

Research Interests

物理化学, フラグメント分子軌道法, 計算化学, SBDD, 分子設計, 分子動力学, 構造活性相関

Published Papers

  1. Compounds Designs of CK2α Inhibitors Derived from Virtual Screening Hit Compounds by Computational Chemistry with Crystallography
    Shinya Nakamura; Keiji Nishiwaki; Masato Tsuyuguchi; Takayoshi Kinoshita; Shinya Oishi; Hiroaki Ohno; Isao Nakanishi
    Chemical and Pharmaceutical Bulletin  72  (9)  , 776-780, 1, Sep. 2024 
  2. Recent progress in the reprogramming of nonribosomal peptide synthetases.
    Fumihiro Ishikawa; Shinya Nakamura; Isao Nakanishi; Genzoh Tanabe
    Journal of peptide science : an official publication of the European Peptide Society  30  (3)  , e3545-, Mar. 2024 
  3. Enhanced inhibitory activity of compounds containing purine scaffolds compared to protein kinase CK2α considering crystalline water
    Keiji Nishiwaki; Shiori Nakatani; Shinya Nakamura; Kenji Yoshioka; Eri Nakagawa; Masato Tsuyuguchi; Takayoshi Kinoshita; Isao Nakanishi
    RSC Medicinal Chemistry  2024 

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Books etc

  1. タンパク質の構造解析手法とIn silicoスクリーニングへの応用事例 , 技術情報協会 , 第６章第1節 , 第６章第1節 , 技術情報協会 , Sep. 2023
  2. 大地からの贈り物サラシア , サラシア属植物普及協会 , 第6章 , 第6章 , メディカルレビュー社 , Feb. 2018

Conference Activities & Talks

  1. Improvement of Pseudo-molecule Generation on Solvent Dipole Ordering Virtual Screening (SDO-VS) , Shinya Nakamura , The 11th China-Japan Joint Symposium on Drug Design and Development , 23, Jun. 2018
  2. 計算化学初心者のための分子動力学計算講習会 ～WindowsPCで行うMD計算の環境作りと失敗しないための考え方～ , 中村真也 , 第8回ケモインフォマティクス入門講座 , 11, Nov. 2017
  3. Practical research of Solvent Dipole Ordering for Drug Discovery , Shinya Nakamura; Shotaku KIMURA; Hayao KITAYOSHI; Isao; NAKANISHI , 第10回分子科学討論会2016神戸 , 15, Sep. 2016

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MISC

  1. Structure activity relationship study of ck2 inhibitors with a pyrazole scaffold by nitrogen scan , 奥村政輝; 中西伸介; 栗本泰奈; 西脇敬二; 中村真也; 大石真也; 大野浩章; 仲西功 , 日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) , 140th , 2020
  2. Structure-activity relationship study of CK2 inhibitors with a pyrazole scaffold by nitrogen scan , 奥村政輝; 中西伸介; 栗本泰奈; 西脇敬二; 中村真也; 大石真也; 大野浩章; 仲西功 , 構造活性相関シンポジウム講演要旨集 , 47th (CD-ROM) , 2019
  3. RAGEを標的とした化学療法誘起末梢神経障害治療薬の探索 in silicoドラッグ・リプロファイリング/リポジショニングからのアプローチ , 脇谷 航平; 関口 富美子; 坪田 真帆; 中村 真也; 仲西 功; 川畑 篤史 , PAIN RESEARCH , 33 , 2 , 157 , 157 , Jun. 2018

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Awards & Honors

  1. Nov. 2017, サラシア属植物普及協会, サラシア属植物普及協会会長賞
  2. Sep. 2016, 日本化学会情報化学部会, Journal of Computer Aided Chemistry論文賞
  3. Sep. 2005, 日本薬学会構造活性相関部会, SAR Promotion Award

Research Grants & Projects

  1. Japan Society for the Promotion of Science, Grants-in-Aid for Scientific Research, Development of COMBINE score function to improve accuracy of virtual screening , Kinki University